More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0853 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  73.7 
 
 
295 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  30.22 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  34.57 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  29.5 
 
 
297 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.41 
 
 
296 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.43 
 
 
294 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  30.58 
 
 
288 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  31.79 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.36 
 
 
314 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.96 
 
 
281 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  34.75 
 
 
288 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.05 
 
 
277 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.72 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.51 
 
 
331 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  29.01 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
287 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.34 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  30.73 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.89 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.64 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.19 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  27.92 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.48 
 
 
324 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
305 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.98 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  25.65 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.89 
 
 
324 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.03 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.03 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.23 
 
 
319 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.41 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.19 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.34 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.54 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.54 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.14 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  28.88 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  27.43 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  28.49 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  30.77 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  30.77 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.18 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.9 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  26.29 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.01 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  27.11 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  25.69 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  25.82 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.41 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.68 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.76 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  26.29 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  24.36 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  25.75 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  29.69 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  23.33 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.46 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.55 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  26.92 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  26.57 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.7 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.59 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.59 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.95 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  26.87 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  28.37 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  26.99 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  23.53 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  25.89 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.3 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  29.53 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  26.15 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.8 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.8 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  24.54 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  26.13 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.34 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.1 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  20.65 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  25.89 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>