More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2866 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  81.91 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.69 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  65.19 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  38.36 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  38.81 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  40.07 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  40.29 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  37.5 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  38.13 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.18 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  36.5 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  32.41 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  32.8 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  32.64 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  30.57 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  28.09 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.95 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  34.5 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  34.5 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.4 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  31.15 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.37 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.74 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.96 
 
 		 347 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.87 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.67 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  33.72 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.65 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  31.11 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.09 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.09 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.37 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  30.62 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  30.17 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  32 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  27.65 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.73 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  30.33 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.52 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  27.85 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.97 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.34 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.15 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  27.51 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  33.66 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.24 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.17 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  27.73 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  25.66 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  25.67 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.42 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  22.87 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.4 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.22 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.42 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.1 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  25.94 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.48 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  22.48 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  30 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.03 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.74 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  27.34 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  27.34 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  26.77 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  24.7 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.22 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.12 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.22 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.69 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.77 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>