More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1899 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  50 
 
 
307 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.77 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  31.06 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
322 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.07 
 
 
331 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.24 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  30.24 
 
 
303 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.09 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  37.24 
 
 
303 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  28.81 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.72 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.76 
 
 
305 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.47 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.98 
 
 
317 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.81 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  31.23 
 
 
298 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  31.34 
 
 
310 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.52 
 
 
288 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.52 
 
 
288 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.52 
 
 
291 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  32.09 
 
 
310 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.93 
 
 
320 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.36 
 
 
315 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27.72 
 
 
305 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
305 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.67 
 
 
317 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  33.93 
 
 
295 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.16 
 
 
287 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  31.82 
 
 
293 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 
314 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
291 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.51 
 
 
313 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.63 
 
 
317 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.8 
 
 
287 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.52 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.29 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.29 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.67 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.99 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  30.18 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.39 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.06 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  26.64 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.7 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  25.87 
 
 
281 aa  95.9  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  33.96 
 
 
295 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  25.87 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  25.87 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  33.49 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  26.42 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.68 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  30.64 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  30.51 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.62 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.73 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.3 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  30.19 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.64 
 
 
311 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.21 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.57 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  29.96 
 
 
284 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  29.15 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.96 
 
 
304 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.63 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  27.62 
 
 
285 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.02 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.13 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.3 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.58 
 
 
307 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  26.26 
 
 
309 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  29.69 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.21 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.29 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.55 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  25.36 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.17 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.66 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  27.7 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  33.66 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  27.81 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.64 
 
 
295 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1342  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  24.24 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  25.18 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  25.53 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  27.8 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>