More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1887 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.54 
 
 		 322 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  56.46 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  52 
 
 		 308 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  54.3 
 
 		 305 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  53.61 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  53.61 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  34.41 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.03 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.97 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  25.61 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.31 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  34.6 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  33.72 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  31.34 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  27 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.18 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.07 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.72 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  33.21 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  26.83 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  26.96 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.75 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  26.76 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.43 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  32.29 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  34.76 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.98 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.85 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.15 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  32.43 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  24.42 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.56 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  26.74 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  25.58 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  24.82 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.48 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  32.04 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.08 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  25.09 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.39 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  29.24 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.79 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  24.39 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.42 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  29.5 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.07 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  24.73 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  23.1 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.5 
 
 		 338 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  25.58 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.78 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  25.77 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.97 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  24.29 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  26.91 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.96 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.53 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  24.65 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  25.99 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  28.77 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29.44 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  28.77 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  29.44 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.96 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.95 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  26.92 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  24.64 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  25.32 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  23.97 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  23.97 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>