More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1902 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  62.9 
 
 		 305 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  62.28 
 
 		 303 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  62.28 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.58 
 
 		 322 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  51.07 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.65 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.04 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.33 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.8 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.15 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  31.51 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.87 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.6 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  31.67 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  32.86 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  30.32 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  34.19 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.8 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.42 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.58 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  33.2 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.38 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.26 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.53 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  26.84 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  33.05 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  25.99 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.97 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.56 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  23.83 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  29.33 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  32.87 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  33.97 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  33.97 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.74 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.93 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  26.89 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.19 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  33.18 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.43 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.43 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.11 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.15 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  31.88 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28.88 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.67 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.75 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.75 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  27.36 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.28 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  32.27 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.69 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  30.4 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  29.07 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  27.56 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  30.15 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  28.29 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.99 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  28.22 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  32.27 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  26.53 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  26.9 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  31.9 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  26.55 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  34.78 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  26.89 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.08 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>