More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1133 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  54.35 
 
 
292 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  53.65 
 
 
292 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  51.47 
 
 
292 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  48.16 
 
 
295 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  49.63 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  49.26 
 
 
311 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  47.79 
 
 
288 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  46.54 
 
 
295 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  46.49 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  45.68 
 
 
288 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  42.18 
 
 
311 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 
313 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  35.56 
 
 
310 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  38.24 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  37.04 
 
 
295 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  34.2 
 
 
315 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  37.55 
 
 
316 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 
295 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  34.55 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
339 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.52 
 
 
333 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  34.43 
 
 
301 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.28 
 
 
317 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  35.38 
 
 
320 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  36.52 
 
 
347 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  35.27 
 
 
289 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  32.73 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  36.67 
 
 
295 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  36.8 
 
 
310 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  33.08 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.1 
 
 
317 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  36.47 
 
 
308 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  35.62 
 
 
310 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  32.86 
 
 
295 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
292 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  34.88 
 
 
317 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  35.45 
 
 
281 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  36.03 
 
 
289 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  31.94 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  36.09 
 
 
295 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  33.81 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  33.69 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.39 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.41 
 
 
289 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
318 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.52 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  32.55 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  32.47 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.56 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  35.9 
 
 
319 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  32.23 
 
 
291 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  30.4 
 
 
301 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.92 
 
 
299 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  32.17 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.08 
 
 
331 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.97 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.38 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
305 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.48 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  31.07 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.12 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.36 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  31.62 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  33.1 
 
 
302 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  32.44 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  35.71 
 
 
318 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.99 
 
 
324 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  35.27 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.52 
 
 
301 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  29.46 
 
 
285 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.64 
 
 
300 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.69 
 
 
316 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.35 
 
 
317 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  29.97 
 
 
307 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.21 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.21 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.36 
 
 
317 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  35.21 
 
 
296 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 
328 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
312 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  29.62 
 
 
307 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31 
 
 
303 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.86 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.41 
 
 
318 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  31.51 
 
 
294 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>