More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2376 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  39.6 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.67 
 
 
303 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 
307 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.65 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.67 
 
 
315 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  32.77 
 
 
324 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  33.45 
 
 
318 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.88 
 
 
331 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  31.52 
 
 
300 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.63 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.33 
 
 
317 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  36.05 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  34.17 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  35.14 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  34.17 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  34.17 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  35.02 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  34.05 
 
 
305 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  31.32 
 
 
285 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.24 
 
 
317 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  35.79 
 
 
321 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  34.6 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 
305 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  31.4 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  34.26 
 
 
318 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  34.78 
 
 
311 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.63 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  35.17 
 
 
296 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  31.4 
 
 
303 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.85 
 
 
312 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  31.41 
 
 
305 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  33.22 
 
 
302 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 
305 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.85 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  31.71 
 
 
308 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.8 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  32.13 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  30.45 
 
 
314 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
322 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
291 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.31 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.45 
 
 
307 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  31.41 
 
 
331 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.2 
 
 
310 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  27.84 
 
 
304 aa  112  9e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  33.58 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.43 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  31.87 
 
 
293 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.92 
 
 
319 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  31.47 
 
 
297 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
301 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.79 
 
 
314 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 
298 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  30.18 
 
 
297 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
301 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  31.56 
 
 
333 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.21 
 
 
320 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.41 
 
 
338 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.04 
 
 
311 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  30.95 
 
 
302 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  33.46 
 
 
274 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
288 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  29.3 
 
 
309 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.29 
 
 
285 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  28.72 
 
 
310 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.62 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
306 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.92 
 
 
281 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  28.52 
 
 
290 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  26.71 
 
 
312 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.25 
 
 
292 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30 
 
 
317 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.03 
 
 
338 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  29.35 
 
 
289 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  25.61 
 
 
289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.73 
 
 
307 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  30.71 
 
 
327 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.82 
 
 
298 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.47 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  29.26 
 
 
284 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29.23 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.87 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.63 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.35 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  30.18 
 
 
291 aa  99.4  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.58 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  35.23 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  33.08 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.1 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>