More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0578 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  88.22 
 
 		 303 aa  500  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  88.22 
 
 		 303 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  62.9 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.3 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  54.3 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  51.9 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  35.14 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.1 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  36.5 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  33.78 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  33.68 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.29 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.32 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.21 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  33.71 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.08 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.29 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  33.19 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  27.55 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  35.32 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.28 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.1 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.45 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  29.76 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.11 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  26.26 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  29.6 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  34.04 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  34.04 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.39 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.89 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  32.35 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.51 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  29.29 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  33.64 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  33.64 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.85 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  29.5 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  33.49 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.1 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.06 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  34.23 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.33 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.06 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  31.88 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.16 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.15 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.62 
 
 		 347 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.62 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.29 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.3 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  27.3 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.99 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  24.36 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  29.78 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  29.96 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  24.32 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2007  hypothetical protein  33.98 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.25 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.19 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.96 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.26 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.12 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.97 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.54 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.93 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.91 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.48 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  28.16 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  31.46 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  25.51 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.35 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.98 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  26.81 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  33.46 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  33.17 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  24.64 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.26 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>