More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10231 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 
295 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  73.7 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  74.23 
 
 
296 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  74.91 
 
 
296 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  46.15 
 
 
295 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  47.33 
 
 
302 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  47.33 
 
 
302 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  40.07 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  43.31 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  45.61 
 
 
304 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  35.19 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  34.07 
 
 
292 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  34.18 
 
 
292 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  32.61 
 
 
291 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
277 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  32.32 
 
 
273 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.24 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.04 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.54 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.95 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 
283 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.57 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.57 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.57 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.97 
 
 
288 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  30.15 
 
 
297 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  26.88 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  29.39 
 
 
297 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  30.11 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.24 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.81 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.18 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.55 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.34 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.73 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
287 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25.18 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  28.78 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.78 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.45 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.35 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  28.22 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  22.54 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.19 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  26.01 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  27.56 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  28.1 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  22.89 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.18 
 
 
311 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  24.48 
 
 
324 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  24.42 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  22.31 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.29 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.97 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.18 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  27.34 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  24.4 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  24.4 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  26.52 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  24.83 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  24.83 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.71 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  21.95 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.28 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.81 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  24.63 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.07 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  23.02 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.84 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  24.91 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.23 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  23.58 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  25.28 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  23.42 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  21.85 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.94 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.04 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  22.7 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  24.51 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  25.42 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  23.43 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  23.84 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  23.05 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>