More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1338 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  100 
 
 
296 aa  586  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  59.46 
 
 
296 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  54.05 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  52.53 
 
 
297 aa  299  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.31 
 
 
297 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  50.83 
 
 
310 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  52.69 
 
 
310 aa  288  8e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  51.94 
 
 
310 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  51.59 
 
 
310 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 
287 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  27.21 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.49 
 
 
288 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 
277 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  27.37 
 
 
301 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  28.28 
 
 
284 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.93 
 
 
281 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  30.25 
 
 
287 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.93 
 
 
281 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.93 
 
 
281 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  27.18 
 
 
273 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.1 
 
 
302 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.03 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  28.62 
 
 
284 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.31 
 
 
324 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  29.72 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  26.33 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.59 
 
 
334 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  28.12 
 
 
307 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.68 
 
 
331 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.95 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  30.8 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  27.09 
 
 
303 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  28.77 
 
 
297 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  28.52 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  29.45 
 
 
269 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.73 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.91 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.34 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  28.24 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.94 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  25.45 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.42 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  26.44 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25.18 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  25.61 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  28.34 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.56 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  25.69 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.8 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.93 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.93 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.74 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  26.5 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  26.94 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  30.17 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25.57 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.59 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.86 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.34 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  24.08 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  25.34 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.25 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  27.97 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  26.01 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.35 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  26.01 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.84 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  28.12 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  25.75 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.61 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.14 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  26 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  28.52 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  25.68 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  23.13 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  23.57 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  21.82 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.04 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.17 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>