More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0395 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  85.61 
 
 		 288 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  85.61 
 
 		 288 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  44.41 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  44.41 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  39.04 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  38.36 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  40.27 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  30.77 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  30.77 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  31.07 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.89 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  26.6 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.89 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  28.52 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.27 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  30.47 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  28.52 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.74 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.68 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.8 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.96 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.47 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.97 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  27.78 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.92 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.95 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.52 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.87 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.61 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  30.2 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  26.52 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.9 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.9 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  26.5 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.8 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  29.39 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.05 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.98 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.45 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.33 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.6 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.92 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.97 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  25.09 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.07 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  23.61 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  26.88 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  24.38 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  31.68 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  24.83 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  25.48 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  24.83 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  25.12 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25.12 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25.12 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.02 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  27 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.72 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  25.93 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  27 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.34 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  27.31 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  25.61 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  23.1 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.41 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  23.13 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  23.63 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  23.89 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.85 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  27.31 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.27 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  26.42 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.41 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.74 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2007  hypothetical protein  21.84 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  27.33 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  26.99 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  25.7 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  28.63 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  27.8 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  28.14 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>