More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2646 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  99.69 
 
 		 318 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  91.5 
 
 		 324 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  66.12 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  67.75 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  58.77 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  57.74 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  52.67 
 
 		 300 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.65 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.49 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  51.48 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  50.5 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  49.18 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  47.9 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  47.57 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  45.42 
 
 		 334 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  46.78 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.08 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.39 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  40.21 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  38.02 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  35.5 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  37.93 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  33.77 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.49 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.99 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  33.89 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  29.93 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  33.62 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.76 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  31.54 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.76 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.25 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.86 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  32.42 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  33.54 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.45 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.28 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.28 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.03 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  34.73 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.28 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30.49 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  32.53 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  32.3 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  32.12 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  32.42 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  30.69 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.29 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  32.74 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.15 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.27 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.62 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.62 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  26.62 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.07 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.86 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.94 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  30 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  29.52 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.68 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.16 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  34.58 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.06 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  35.1 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  35.14 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.07 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.74 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.61 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.31 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.96 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.97 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.72 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.11 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  29.31 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.87 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  29.35 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  32.89 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  30.99 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.97 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.28 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>