282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0778 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  585  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  59.46 
 
 
296 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  50.67 
 
 
297 aa  287  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  47.02 
 
 
310 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 
297 aa  261  8e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  48.4 
 
 
310 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  46.69 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  47.04 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  47.31 
 
 
310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.3 
 
 
287 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.23 
 
 
292 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.01 
 
 
281 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.31 
 
 
287 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
277 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.66 
 
 
281 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.66 
 
 
281 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.3 
 
 
301 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  26.83 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.99 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.33 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.3 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  28.22 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  28.22 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.54 
 
 
287 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.82 
 
 
302 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.62 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  29.11 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.07 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  29.1 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.09 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  26.12 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  28.9 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.16 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  24.07 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  26.55 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  26.23 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.52 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.52 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.63 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.84 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.88 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.06 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.15 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  26.82 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  27.42 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.69 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  25.63 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.74 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  19.93 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0774  hypothetical protein  24.63 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  29.23 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  26.67 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.92 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  26.12 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  24.82 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  26.35 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  25.5 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  25.53 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  24.82 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  25.27 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  29.79 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  24.65 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  22.26 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.37 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.35 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  27.1 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  23.51 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  25.09 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  26.71 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  25.6 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  23.89 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.95 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  32.28 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  23.08 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  23.08 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  23.68 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  25.33 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  31.34 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  25.56 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  31.34 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  25.33 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  23.21 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  23.45 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>