165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3368 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  100 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  68.15 
 
 		 298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  56.12 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  48.43 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  51.74 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  50.17 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 303 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  45.87 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  45.76 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  45.64 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  48.41 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  48.45 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 329 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  44.26 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.84 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  38.95 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  36.16 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  41.01 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  34.91 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  33.1 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.16 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.34 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  30.62 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.4 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  25.61 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  30.11 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.3 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.3 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.3 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.88 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.57 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.51 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  26.35 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.27 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  26.04 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.82 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.42 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  31.34 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.09 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.76 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.86 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  30.6 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  23.78 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  20.21 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  22.84 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  23.94 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  24.54 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.67 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  26.9 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  25.09 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.28 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  32.84 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.21 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.01 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  25 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.5 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  29.96 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.89 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.18 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  24.09 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.27 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  24.64 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  24.91 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  24.08 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.18 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.91 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  31.34 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  26.41 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  33.83 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.3 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  25.44 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6087  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.866624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.41 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  26.76 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  24.18 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.56 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>