184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1824 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.18 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.18 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.18 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.36 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.67 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.1 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.86 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.18 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  27.03 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.14 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.52 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  26.96 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  30.56 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.16 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.76 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  30.07 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.68 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  26.33 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.28 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.19 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.28 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.09 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  26.77 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  26.12 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  27.21 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.99 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  28.08 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  31.34 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.74 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.34 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  27.7 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  23.51 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  25.42 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  25.72 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.88 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  29.5 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  25.71 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.3 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.23 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  32.75 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  25.36 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.57 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.89 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.67 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.44 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  22.71 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  23.97 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  30.65 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  28.63 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  27.12 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  23.39 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  21.71 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  26.83 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  22.45 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.89 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  24.3 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  23.1 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  23.37 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  21.4 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  27.99 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1172  hypothetical protein  30.58 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  27.63 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.35 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  27.21 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  32.37 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  25.32 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  24.92 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  28.22 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  23.67 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  27.73 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  26.85 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  25.54 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.62 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  26.46 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  24.19 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  30 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.34 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>