More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0248 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  74.49 
 
 		 291 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  62.93 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  63.92 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.93 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  63.27 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  63.57 
 
 		 306 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  66.06 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  62.59 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  63.23 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  63.92 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  62.54 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  57.99 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  58.02 
 
 		 290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  35.07 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  36.03 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  33.81 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  35.48 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  38.03 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  35.69 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  36.88 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  34.46 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  35.27 
 
 		 215 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  33.2 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  32.8 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  32.94 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  30.07 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  32.55 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  30.59 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  30.59 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  30.23 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.1 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.16 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.58 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.88 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.62 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.15 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.24 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.61 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.61 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  24.83 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.61 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  27.82 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.92 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.61 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  29.95 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.26 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.06 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.47 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  27.66 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  29.96 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.14 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.97 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.47 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  31.77 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.91 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.14 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  31.66 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.3 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29.95 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  29.95 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.28 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.4 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  28.46 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  31.2 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  26.89 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.4 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  25.42 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.95 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28.74 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.85 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.4 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.4 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.87 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  26.86 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.38 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  26.55 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  28.96 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.97 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.65 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  28.99 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  27.68 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  30.73 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.06 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.56 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>