More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4255 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  62.41 
 
 		 291 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  63.57 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.57 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  66.3 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  62.89 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  62.89 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  65.58 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  62.54 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  65.94 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  65.22 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  65.58 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  60.95 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  55.47 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  36.04 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  36.93 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  36 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  35.38 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  38.29 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  37.55 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  35.51 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  37.96 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  37.55 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  37.55 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  36.95 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  37.2 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  36.55 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  36.55 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  37.3 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 		 283 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  36.17 
 
 		 215 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  30.36 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  26.53 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.09 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.26 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.26 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.36 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.16 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  27.88 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.37 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.08 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  28.89 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.23 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  26.41 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.1 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  26.74 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.4 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.77 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.65 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.03 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  33.01 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.35 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.02 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  29.11 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.84 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.19 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  30.74 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.55 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.19 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.19 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.43 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  27.86 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.01 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.73 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.67 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  26.43 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.73 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.39 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.14 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.94 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  26.27 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  25.17 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.14 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.52 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  25.68 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  25.62 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.88 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>