More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2971 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 283 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  99.29 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  98.59 
 
 		 283 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  98.59 
 
 		 283 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  92.23 
 
 		 283 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  91.52 
 
 		 283 aa  517  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  92.23 
 
 		 283 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  88.3 
 
 		 283 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  66.08 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  34.49 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  34.07 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  34.31 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  36.94 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  28.06 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  31.45 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  33.99 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  32.26 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  31.27 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  30.11 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  31.92 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  31.94 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  27.72 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.31 
 
 		 342 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.82 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.06 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.94 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.48 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  30.86 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.35 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  27.82 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  26.95 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.18 
 
 		 317 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.83 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.83 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.02 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.44 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.41 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.14 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.87 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.21 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.37 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.44 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.97 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  27.02 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  31.34 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  32.53 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.67 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  27.72 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  28 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.67 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  24.81 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  27.74 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.03 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.68 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  25.51 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  25.18 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  31.08 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.59 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.48 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.94 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.12 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  24.26 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  25.19 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.35 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.76 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.14 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  28.42 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.41 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.14 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  26.09 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.76 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  28.78 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.17 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.72 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  24.83 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  24.29 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  27.57 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>