More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0296 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  94.79 
 
 		 306 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  94.79 
 
 		 306 aa  577  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  95.11 
 
 		 306 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  87.3 
 
 		 307 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  87.07 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  86.39 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  86.73 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  86.05 
 
 		 294 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  62.98 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  63.92 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  66.3 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  65.33 
 
 		 290 aa  346  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  60.58 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  35.36 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  38.73 
 
 		 286 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  39.08 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  36.79 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  32.99 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  34.78 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  33.09 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  34.44 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  34.57 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  34.56 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  34.93 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  35.45 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  34.56 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  34.93 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  34.93 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  34.56 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 283 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  35.69 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.35 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.86 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  26.24 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  24.67 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.89 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.82 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.93 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.41 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.89 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.37 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.99 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  28.79 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.07 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.7 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  26.24 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.16 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.39 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.67 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  29.82 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.75 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  25.89 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.61 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  26.16 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  26.64 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.22 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  25.53 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  34.36 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  26.94 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.41 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.89 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.85 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  29.31 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  24 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  22.87 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.35 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.14 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  30.49 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  32.29 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  26.92 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.21 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  27.4 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  24.67 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  32 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  32 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.01 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  27.41 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.63 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.01 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.01 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  27.72 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>