More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0250 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  86.18 
 
 		 306 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.76 
 
 		 301 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  65.76 
 
 		 307 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  57.05 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  45.52 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  45.42 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.7 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  41.76 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.31 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  34.05 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.45 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.77 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.85 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  30.22 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.97 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.99 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  32.19 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  31.8 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  31.8 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.1 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  31.1 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.51 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.45 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.53 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.9 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  34.6 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.77 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  33.22 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.14 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  31.29 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  30.68 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.83 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.64 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.12 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.06 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.04 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.65 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.49 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.6 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  31.62 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.61 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.19 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.51 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.61 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.61 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.33 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.11 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 325 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.26 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.08 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  29.29 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.62 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  31.29 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.14 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.31 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  29.37 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  32.25 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.75 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.82 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  29.02 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.39 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  30.45 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.98 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.31 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.99 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  30.47 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  31.21 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  32.09 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.16 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.65 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 273 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>