More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0418 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.82 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  37.13 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  36.76 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  36.76 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.79 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  35.27 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.49 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  36.67 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.91 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  32.47 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  35.66 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  35.66 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  34.62 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  35.23 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  35.56 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  34.93 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.49 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.01 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  30.18 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.18 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.64 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  31.52 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  32.52 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  33.45 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.6 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.18 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  32.01 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.13 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  34.6 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  30.45 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  29.07 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.21 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  32.49 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  32.27 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31.64 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.78 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  32.85 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  32.52 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  28.32 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.27 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.27 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  31.05 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  34.01 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.33 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  33.63 
 
 		 276 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.98 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  33.97 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  32.38 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.15 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.13 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  29.5 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  31.5 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  25.68 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  29.07 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  28.25 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  30.37 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.87 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.35 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.62 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  29.31 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.36 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.28 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.13 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  31.12 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.6 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  26.44 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.27 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29.7 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>