More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1857 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  36.53 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  32.42 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.18 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.9 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.69 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.91 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  33.58 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  32.44 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  33.79 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.27 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.09 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.94 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.12 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  26.74 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  33.33 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.56 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  32.37 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  26.35 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  32.88 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  29.2 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.76 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.75 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.34 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  32.29 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  27.34 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  27.34 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  29.85 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30.23 
 
 		 317 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.59 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.03 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.21 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.14 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.07 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  27.74 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.6 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  31.62 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.63 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  32.05 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.8 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  27.96 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  34.52 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.46 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.62 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.62 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  26.41 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.84 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  32 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.69 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  30.91 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  29.71 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.33 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  23.77 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  30.18 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  26.88 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  25.89 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  24.5 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  29 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  31.96 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  29.97 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.55 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  26.85 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.39 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  26.76 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.79 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>