299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0341 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  98.7 
 
 
308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  77.27 
 
 
308 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  45.3 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.73 
 
 
301 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  45.14 
 
 
302 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  47.06 
 
 
316 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.66 
 
 
302 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  43.01 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.3 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  44.44 
 
 
297 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  38.46 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  42.91 
 
 
286 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  38.83 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  38.83 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  36.45 
 
 
294 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  39.79 
 
 
305 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  35.84 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  35.79 
 
 
299 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 
294 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  35.45 
 
 
323 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  35.45 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  32.39 
 
 
331 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.06 
 
 
337 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  35.18 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  37.06 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  34.58 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
287 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  34.26 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.11 
 
 
331 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  34.13 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  34.15 
 
 
304 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  33.8 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  35.86 
 
 
289 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.32 
 
 
285 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.8 
 
 
285 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.4 
 
 
328 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.41 
 
 
333 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.47 
 
 
291 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
305 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.91 
 
 
315 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.72 
 
 
333 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
318 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.49 
 
 
320 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
298 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.82 
 
 
317 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.25 
 
 
291 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.32 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.09 
 
 
281 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  29.87 
 
 
306 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.31 
 
 
309 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
318 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 
313 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  33.91 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.67 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  32.87 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  29.27 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  31.02 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  29.84 
 
 
305 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
314 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  30.69 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.76 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  32.4 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.28 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.79 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.85 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.87 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.39 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  29.82 
 
 
307 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.17 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  30.99 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  26.4 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.62 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.16 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.84 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.14 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  29.47 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  31.23 
 
 
311 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30 
 
 
319 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.75 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  33.7 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.7 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.75 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>