More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1998 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  99.32 
 
 		 323 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.32 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  98.98 
 
 		 323 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  87.02 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  53.68 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  48.43 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  43.71 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  44.17 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  44.52 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  44.17 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  40.93 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  43.73 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.59 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  37.28 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  38.49 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  35.99 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  35.64 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  35.67 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  35.79 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  35.79 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  36.33 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.97 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  35.92 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  34.42 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  28.77 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  32.08 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  32.89 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.19 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.34 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.51 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.08 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.86 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  29.6 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  32.59 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.66 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.57 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.28 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.9 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  25.71 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.13 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.01 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.93 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  33.01 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.8 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  30.64 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.2 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.21 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.2 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.84 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  33.83 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  30.14 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.09 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  28.04 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.44 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.62 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.29 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  24.14 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.35 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  27.49 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  31.7 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.05 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.83 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  28.18 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.62 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.72 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.06 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.35 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.87 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.55 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.35 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.35 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.61 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.34 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.84 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.78 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.28 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2496  hypothetical protein  26.62 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.580148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.38 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>