296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1160 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  99.66 
 
 
294 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  86.39 
 
 
294 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  45.74 
 
 
286 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  50.36 
 
 
306 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  45 
 
 
297 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  47.18 
 
 
288 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 
294 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  44.17 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  44.17 
 
 
323 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  44.17 
 
 
323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  43.73 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.94 
 
 
302 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  44.22 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.06 
 
 
302 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  41.11 
 
 
297 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  42.2 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  39.29 
 
 
308 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  38.83 
 
 
308 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  38.83 
 
 
308 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  44.48 
 
 
305 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  38.36 
 
 
288 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  40.28 
 
 
295 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  36.46 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 
301 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  37.19 
 
 
308 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  39.78 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.67 
 
 
337 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
314 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  32.56 
 
 
310 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.11 
 
 
315 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  36.75 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  35.14 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.97 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  30.69 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  34.15 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  34.8 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.74 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  37.29 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  38.61 
 
 
311 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.79 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  33.22 
 
 
309 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  30.31 
 
 
331 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  31.21 
 
 
317 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  31.89 
 
 
309 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  33.8 
 
 
285 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
298 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.99 
 
 
291 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  33.79 
 
 
304 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.22 
 
 
307 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.56 
 
 
285 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  33.01 
 
 
313 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.77 
 
 
319 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.56 
 
 
294 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.88 
 
 
294 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
293 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
287 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  33.19 
 
 
289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  34.07 
 
 
297 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  34.76 
 
 
317 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.74 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.51 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  34.07 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.99 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.38 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.82 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  33.33 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.23 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.11 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.54 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  30.9 
 
 
305 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.49 
 
 
317 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  33.22 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29.15 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  29.15 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  29.49 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.72 
 
 
342 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  26.24 
 
 
318 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.99 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  32.27 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  33.49 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
318 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  36.97 
 
 
316 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31.54 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.27 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.27 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.93 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>