268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1038 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  31.67 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  36.55 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  36.9 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  36.55 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  36.46 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  33.21 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  36.04 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.08 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  33.83 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  32.42 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  32.42 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.46 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  31.96 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  34.49 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  34.49 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  34.14 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  32.88 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.36 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  32.52 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.42 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  30.39 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  29.34 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  27.64 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  25.9 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  25.59 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.88 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.6 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  25.9 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  28.1 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.86 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  30.72 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.96 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.01 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.95 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.01 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.44 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  26.82 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  26.97 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  26.86 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.23 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.71 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  26.55 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  26.83 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 339 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  28.36 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.84 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.71 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  28.12 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.23 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  25.75 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.86 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  24.01 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.95 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.46 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.15 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  26.58 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  25.82 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  27.76 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.04 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  29.21 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.37 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  27.52 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3630  hypothetical protein  32.6 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  26.78 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  29.37 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  24.49 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.37 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.19 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  27.62 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.7 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>