More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0424 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  100 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  63.64 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  60.73 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.39 
 
 		 301 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  57.05 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  48.82 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  47.52 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.07 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.57 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  39.22 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  38.38 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  35.71 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.57 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.49 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  33.44 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  33.01 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  35.54 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  33.22 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.96 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  33.11 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.22 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.2 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  34.84 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  31.73 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  31.29 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  35.15 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.8 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.76 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  34.46 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  32.29 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.75 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  35.33 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  32.41 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.94 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.75 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.13 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  31.6 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  35.99 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.53 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  32.19 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.42 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.31 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  32.52 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  32.52 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  32.17 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  31.79 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.68 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  36.02 
 
 		 319 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  33.49 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.67 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.1 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.99 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.14 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  31.16 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  27.95 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  32.87 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.06 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  32.52 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  30.64 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.4 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.66 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.58 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  30.58 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  33.08 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  34.15 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  34.58 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.09 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  33.68 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.38 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.34 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  30.33 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  33.68 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.58 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.09 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.36 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.16 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.03 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.31 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>