More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0131 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.22 
 
 
328 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  56.12 
 
 
317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  52.26 
 
 
318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  56.8 
 
 
317 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  56.8 
 
 
317 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  53.77 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  37.36 
 
 
311 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  35.69 
 
 
291 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  33.22 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  35.79 
 
 
317 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  35.34 
 
 
305 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 
293 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 
293 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.12 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.94 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 
314 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  32.36 
 
 
319 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  34.98 
 
 
281 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  32.86 
 
 
289 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.56 
 
 
311 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  32.13 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.72 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  33.9 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.21 
 
 
313 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  30.11 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.8 
 
 
312 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  32.06 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  35.12 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  30.8 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  30.9 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.35 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.18 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.48 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.56 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.56 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  29.63 
 
 
320 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
305 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.4 
 
 
295 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.56 
 
 
308 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.82 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.97 
 
 
291 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.01 
 
 
316 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  34.2 
 
 
307 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.8 
 
 
331 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.65 
 
 
303 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  34.83 
 
 
305 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
318 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.77 
 
 
288 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.58 
 
 
324 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.07 
 
 
312 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.03 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.06 
 
 
308 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  31.52 
 
 
319 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.57 
 
 
307 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.92 
 
 
297 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.12 
 
 
318 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  32.29 
 
 
337 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.67 
 
 
292 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.63 
 
 
333 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.15 
 
 
292 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  31.05 
 
 
309 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  28.26 
 
 
333 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.15 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.15 
 
 
311 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  33.46 
 
 
305 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  36.95 
 
 
303 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  36.45 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  32.61 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  34.26 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
312 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.59 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33.93 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.29 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.33 
 
 
289 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  30.98 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  32.86 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  31.36 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  31.52 
 
 
338 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  29.71 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0900  hypothetical protein  29.25 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>