More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3772 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  91.42 
 
 
305 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  60.55 
 
 
311 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  57.14 
 
 
291 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  33.56 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 
328 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35 
 
 
317 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  34.59 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  33.22 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33 
 
 
315 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.67 
 
 
310 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.51 
 
 
317 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.51 
 
 
317 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.11 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
305 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.54 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.7 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.82 
 
 
317 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  31.01 
 
 
291 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  32.48 
 
 
309 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.87 
 
 
309 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.14 
 
 
331 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  31.16 
 
 
305 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.29 
 
 
306 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
289 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.75 
 
 
342 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.43 
 
 
297 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.71 
 
 
331 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.07 
 
 
308 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.74 
 
 
289 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.86 
 
 
281 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  32.32 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.45 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.66 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.06 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  32.5 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  26.39 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  29.72 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.3 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.51 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  28.33 
 
 
320 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.06 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.42 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.87 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  27.68 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.74 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
306 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  31.03 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  25.84 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.27 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  29.47 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  27.4 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.13 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.93 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.55 
 
 
292 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.85 
 
 
292 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  29.64 
 
 
289 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.55 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.27 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.03 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  27.5 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.51 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.1 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.02 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.86 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  30.85 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28 
 
 
312 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.17 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.93 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  30.85 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  30.73 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 
325 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.27 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.8 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  29.72 
 
 
294 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  27.65 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  27.85 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  29.72 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>