286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2143 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  100 
 
 		 297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  64.39 
 
 		 289 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  63.6 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  42.28 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  40.89 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  36.79 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  36.36 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  36.17 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  35.34 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  35.69 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  36.33 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  38.63 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  34.77 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  37.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.24 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  34.24 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  34.13 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  34.13 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  44.9 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  36.52 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  35.04 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  36.94 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  34.07 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  35.45 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  35.82 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  34.29 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  36.19 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.94 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  36.94 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  36.57 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  36.57 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  35.07 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  36.12 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  36.12 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  32.81 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  31.4 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  28.92 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.64 
 
 		 331 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  27.53 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.32 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.92 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.69 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.26 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.15 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.09 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.77 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  32.81 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.15 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.6 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.15 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.27 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.83 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.88 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.39 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.78 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.48 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.31 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.5 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  31.02 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.32 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  29.13 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29.13 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  28.74 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.64 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.86 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.71 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  28.84 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.44 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.73 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  29.46 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  26.94 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  28.67 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.21 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  35.57 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.3 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  29.74 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.7 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  27.13 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.54 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.25 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>