225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1275 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  97.55 
 
 		 286 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  52.14 
 
 		 311 aa  308  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  54 
 
 		 215 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  36.08 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  41.52 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  41.16 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  41.3 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  40.79 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  38.73 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  41.26 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  37.46 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  38.03 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  37.1 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  37.97 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  37.41 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  40 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  37.77 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  37.25 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  37.15 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  37.27 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  36.88 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  26.87 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  26.87 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  27.82 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  25.1 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30.66 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.76 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  26.45 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  23.43 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  25.44 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  24.01 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  24.33 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.94 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  25.45 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  24.49 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  29.89 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  22.34 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  24.64 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.83 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25.19 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  26.94 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.34 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.47 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  24.41 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  24.91 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.1 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  22.81 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  22.5 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.19 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  22.14 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  23.46 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  23.57 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  23.46 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  23.46 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  22.5 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  24.08 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  22.56 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.51 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  24.65 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  28.5 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  26.74 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  23.15 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  24.8 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  23.97 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  23.33 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  22.45 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  25.89 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.07 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  25.94 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  22.89 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.07 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  29.67 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  24.74 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  24.74 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  27.01 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.36 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.36 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  25.35 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>