297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1856 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  583  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  50.71 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0426  hypothetical protein  45.24 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1767  hypothetical protein  34.15 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000998556  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.59 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  26.28 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.18 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  25.91 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  32.73 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  31.67 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.29 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.14 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  24.92 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  26.28 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  29.89 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.47 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.89 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.19 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.67 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  31.48 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.13 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.04 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.43 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.14 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  26.35 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.78 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.65 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.48 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.72 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.83 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  24.34 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  29.79 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  27.19 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  24.65 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  29.79 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  29.43 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  28.83 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  31.55 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.16 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  23.22 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  23.22 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.07 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  33.77 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.87 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  30.39 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  27.01 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  24.36 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.02 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  27.01 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  26.79 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.88 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.11 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.91 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  29.62 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  25.9 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  28.51 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  30.14 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.4 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.5 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  29.09 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  27.55 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  28.09 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.23 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  28.07 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.64 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.84 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  28.98 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  27.4 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  27.66 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  25.54 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  25.54 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  28.15 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  29.87 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  28 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  25.75 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  27.31 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  25.75 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.11 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.17 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  26.38 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.57 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  24.56 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.09 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.37 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  25.72 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>