237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0426 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0426  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  47.37 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  45.24 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1767  hypothetical protein  36.93 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000998556  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.01 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.96 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.88 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.63 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  33.04 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.87 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.9 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.55 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.12 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.31 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.04 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  29.86 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.43 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  25.95 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  28.15 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  28.45 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  29.27 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.71 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  28.12 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.94 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  25.91 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  28.03 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  28.86 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  25.67 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  28.86 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  31.67 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  27.35 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  27.76 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  26.58 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.45 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.45 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.84 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  31.28 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  28.63 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.55 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  27.35 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.12 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.94 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  26.28 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.43 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  27.44 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  26.16 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  27.17 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.65 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.46 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.38 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  24.22 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  31.34 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.21 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  25.57 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  27.02 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.35 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  26.61 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  26.61 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  25.95 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  26.26 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  27.74 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.18 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.84 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.53 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.68 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  29.64 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  26.49 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>