211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2635 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  100 
 
 		 298 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  68.15 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  55.78 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  49.31 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  48.32 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  48.97 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  47.95 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  50.88 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  49.15 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  49.01 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  49.01 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.16 
 
 		 329 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  47.89 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  47.3 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  42.9 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.3 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  39.1 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  39.79 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  39.93 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  36.1 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  32.09 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.47 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.87 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.53 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.53 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  32.17 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  35.14 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30.5 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  30.5 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.21 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.07 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  32.53 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.23 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.52 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  32.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.37 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.57 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.91 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.59 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  32.13 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.24 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29.64 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.08 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.41 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.06 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.3 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  24.04 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  25.83 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  30.94 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.52 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.09 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.24 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  33.81 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  26.43 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  25.72 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.17 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.87 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.81 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.92 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.65 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  22.74 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  22.38 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  25.59 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  32.88 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  28 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  28.42 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.96 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.4 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.03 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.93 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.94 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>