242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0537 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  100 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  67.31 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  67.47 
 
 		 310 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  67.47 
 
 		 310 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  52.03 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  45.67 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  44.55 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  41.78 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.55 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  27.12 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.9 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  27.36 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.04 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.06 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  30.03 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  26.4 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.13 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.16 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  25.68 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  26.56 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.78 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  26.56 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  26.56 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  26.58 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.39 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.78 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.91 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.73 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  30.98 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.05 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.26 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  28.09 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  29.87 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  25.75 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.66 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  25.89 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  27.7 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  25.17 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  26.89 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  27.3 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  24.03 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  26.14 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  26.6 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  23.93 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.66 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  25.83 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  24.35 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.14 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  24.5 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  22.65 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  24.6 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  24.09 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  23.51 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  25.95 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  32.61 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  24.41 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  25.33 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  23.18 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  25.94 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  23.79 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  24.58 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  23.1 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  23.84 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  24.9 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  24.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  25.59 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  22.44 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.24 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  22.44 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  29.89 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  24.91 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  22.73 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  22.8 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.18 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.35 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.55 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  23.92 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>