247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0434 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  99.03 
 
 
310 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  99.03 
 
 
310 aa  607  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  67.35 
 
 
310 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  50.83 
 
 
296 aa  289  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  46.69 
 
 
296 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  42.95 
 
 
297 aa  243  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  43.97 
 
 
295 aa  238  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.33 
 
 
297 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.56 
 
 
287 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.47 
 
 
292 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.29 
 
 
296 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.14 
 
 
301 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.21 
 
 
273 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.68 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.24 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.24 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  30.23 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.84 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.96 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.92 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.21 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.7 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  24.03 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.43 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.77 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.3 
 
 
292 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.03 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.93 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  25.5 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  30.03 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.42 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.67 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  28.01 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  26.3 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  27.1 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  25.97 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.64 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  26.54 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  25.95 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.03 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  27 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.14 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  24.83 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  27.33 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  28.47 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.84 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  26.6 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.09 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  25.57 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  23.96 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  24.66 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  28.36 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  25.91 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  27.18 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  22.04 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  25.09 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  28.05 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.47 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  25.97 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  25.85 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  25.17 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25.16 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.04 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  23.2 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  24.68 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  22.73 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  25.08 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  23.1 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  23.34 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  20.33 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  23.79 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  23.39 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  22.77 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  25.81 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  23.97 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  25.26 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  24.92 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  24.91 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  22.58 
 
 
312 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.74 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  30.22 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  27.59 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  25.08 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  23.81 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>