More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0226 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 273 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.7 
 
 		 273 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  33.82 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.39 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  32.73 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.96 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.16 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.16 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.16 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.43 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  32.84 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  30.11 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  31.16 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.96 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.3 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.67 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.11 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.78 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.26 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  28.1 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.77 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  27.92 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  28.21 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.04 
 
 		 301 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.78 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.71 
 
 		 309 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.58 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.24 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  27.36 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.11 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  31.83 
 
 		 319 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  28.47 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.34 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.73 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.77 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  28.29 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.73 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.52 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  28.88 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  30.62 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  28.17 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.91 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.36 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  28.14 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  30.4 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.66 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  28.22 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  28.32 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.91 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  26.02 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.86 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  26.72 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.32 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.45 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  25.89 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  30.88 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  30.88 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.24 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  27.17 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  26.56 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6087  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.866624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  26.77 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.74 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  26.51 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  27.44 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  28.63 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>