288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2600 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  62.2 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  37.83 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  37.28 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  37.26 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  37.02 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  38.02 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  38.02 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  34.27 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  37.98 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  37.63 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  34.52 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  32.95 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  32.44 
 
 		 338 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  32.06 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  32.58 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  40.23 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.6 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  33.09 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.45 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  30.22 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.69 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  29.46 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.18 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.78 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  27.43 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  32.97 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.25 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  28.92 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.92 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.31 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.72 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.07 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  25.27 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.52 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  28.18 
 
 		 295 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  32.63 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  31.15 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  29.08 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  22.26 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.14 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.63 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.4 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  28.42 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  29.33 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  23.84 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.27 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  25.48 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  28.17 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.44 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  26.98 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.56 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  31.29 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  26.37 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  28.76 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  30.21 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.66 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29.92 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  26.98 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  26.98 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.6 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  28.98 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  26.3 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.3 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.71 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  26.86 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  26.89 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  25.18 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.67 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.22 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.22 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  30.2 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.99 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>