More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09181 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  94.59 
 
 
296 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  87.84 
 
 
296 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  74.91 
 
 
295 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  47.33 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  48.56 
 
 
302 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  43.53 
 
 
302 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  46.6 
 
 
302 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  44.69 
 
 
302 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  44.41 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  35.79 
 
 
292 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  36.16 
 
 
301 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  36.01 
 
 
292 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  37.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
277 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  32.7 
 
 
273 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30.29 
 
 
284 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.72 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.2 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.85 
 
 
284 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.21 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.21 
 
 
281 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.21 
 
 
281 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  32.81 
 
 
297 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  32.41 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.86 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.69 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.49 
 
 
324 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.31 
 
 
318 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.31 
 
 
318 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
291 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  30.66 
 
 
296 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  27.17 
 
 
277 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.66 
 
 
294 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  32.44 
 
 
287 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  29.39 
 
 
291 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  32.44 
 
 
287 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  29.17 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.06 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.38 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.06 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.24 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  28.16 
 
 
305 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  29.14 
 
 
277 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.52 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  27.13 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.76 
 
 
313 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  26.98 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  26.57 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  26.57 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  23.83 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.14 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  30.15 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.6 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  27.42 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  27.3 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.57 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.55 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25.33 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.93 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.72 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.34 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  25.33 
 
 
347 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.93 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  25.28 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  23.78 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.82 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.58 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  22.31 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.57 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  27.48 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.39 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  27.48 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.69 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  24.16 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  23.43 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.33 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  25.24 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.91 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  24.22 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  22.3 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  22.3 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  22.3 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  23.88 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  25.09 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>