212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2308 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  24.81 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.06 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.23 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  23.95 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  22.7 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  23.53 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  23.53 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  30.36 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.37 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.87 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  19.78 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  24.9 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  31.28 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  22.81 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.06 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  24.91 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  25.55 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  22.57 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  22.3 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  21.99 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  26 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  23.45 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  25.41 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  24.83 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  31.31 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  19.7 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  20.8 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  24.64 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  25.73 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.4 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  25.96 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  28.85 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  19.69 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.47 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  22.69 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  25.48 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.76 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  24.55 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  24.43 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  25.49 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  26.64 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  24.83 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  21.8 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  21.11 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  27.72 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  25.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  27.72 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  25.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  26.94 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  23.9 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  22.51 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  24.23 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.72 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  24.09 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.32 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  26.78 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  24.41 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  27.44 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  21.99 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  21.98 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  22.43 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  22.43 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  26.77 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.09 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  24.27 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  21.72 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  24.03 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  21.72 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  25.97 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.89 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  29.26 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  24.64 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.1 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  25.7 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  24.63 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  25.74 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  25.09 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.42 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  23.11 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  25.22 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  26.64 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>