97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4193 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  33.47 
 
 
333 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  33.78 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1172  hypothetical protein  32.64 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  29.5 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.92 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.44 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1129  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.11 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.57 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.2 
 
 
288 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.2 
 
 
288 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  24.68 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.82 
 
 
302 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  25.89 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.1 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  25.11 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  22.77 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.2 
 
 
331 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  25.45 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  25.57 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  24.64 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  24.16 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.5 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.16 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.82 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.96 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.79 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  24.02 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  23.89 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  26.78 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.77 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  26.13 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  28.31 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.89 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  24.68 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.23 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.51 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  22.99 
 
 
273 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.77 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 
287 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.34 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  25.96 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.63 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.61 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  25.52 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.87 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.27 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  42.37 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  25.52 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  22.12 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  25.64 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  26.91 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.47 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  24.6 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  32.11 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.07 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.94 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  26.74 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  23.56 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.75 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.75 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  25.82 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.75 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  25.82 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  30.4 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.17 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.94 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  26.21 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>