112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1258 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
310 aa  580  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.35 
 
 
310 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1129  hypothetical protein  96.6 
 
 
310 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1172  hypothetical protein  85.11 
 
 
304 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  54.18 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  51.01 
 
 
333 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.85 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.38 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.02 
 
 
277 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  30.36 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  29.58 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  25.44 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  30.57 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.96 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  24.9 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.44 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.85 
 
 
284 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.24 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  24.18 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  25.63 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  33.77 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.05 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.41 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  25 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.91 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  22.27 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  32.74 
 
 
305 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  22.27 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  22.27 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.71 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.92 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.58 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  31.65 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.31 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  28.8 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.75 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  22.61 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  31.02 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  24.18 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  31.02 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.06 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  38.05 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  24.18 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  27.89 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.48 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.32 
 
 
304 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
329 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  23.77 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
305 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.35 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  35.15 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.04 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  28.07 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.13 
 
 
299 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 
298 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  29.32 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
305 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  34.36 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  25.17 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  25.17 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  26.83 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.97 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  25.62 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  27.81 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  29.57 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.05 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  35 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  30.04 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.41 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.27 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  21.33 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.75 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  18.47 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.45 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.03 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  23.58 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  32.73 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  24.76 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  31.96 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>