More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4402 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 335 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  51.04 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  49.14 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  49.83 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  51.59 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.1 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  46.51 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.84 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  33.56 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  31.38 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.38 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  28.68 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  33.55 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  31.48 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  31.48 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  31.48 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  31.46 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  30 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  31.11 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  29.63 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  28.14 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  29.63 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  32.14 
 
 		 298 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.87 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  30.41 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  32.74 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.04 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  30.21 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.24 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  28.74 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  29.1 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.91 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.26 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.76 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  26.87 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  26.87 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.91 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.91 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.91 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.91 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  27.17 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.62 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  26.58 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.04 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  30.93 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.64 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.49 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  30.24 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.9 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.95 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.51 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.83 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  29.03 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  28.21 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.07 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.77 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.44 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.15 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.08 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  27.68 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>