163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3062 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  89.58 
 
 		 288 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  75 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  75.96 
 
 		 290 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.74 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  75.96 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  64.41 
 
 		 294 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  76.31 
 
 		 289 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.59 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  59.51 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.54 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  55.48 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  55.48 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  54.06 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  55.36 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  57.04 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.77 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  52.31 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  46.23 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  42.66 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  42.66 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  47.69 
 
 		 303 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  40.14 
 
 		 314 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  37.32 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  38.7 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  35.88 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  38.33 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  30.68 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  30.28 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  47.62 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  25.85 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  26.34 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  26.85 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  27.72 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  27.72 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  27.72 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  27.34 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  27.24 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  24.1 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  34.35 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  28.23 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  24.1 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  24.1 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.1 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  25.14 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  25.51 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  27.99 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  27 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  28.65 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  27.09 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  23.55 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  27.09 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  28 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  28.51 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.37 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  27.38 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  23.53 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  22.68 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  27.68 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  26.77 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  26.53 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.65 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.45 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  24.07 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.18 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  23.97 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  25.47 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.16 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.29 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.29 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  28.32 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.42 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>