157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6429 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  46.98 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.55 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.88 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  44.37 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  47 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  45.77 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  43.31 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  43.93 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  45.26 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  41.84 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  42.4 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  41.2 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  47.15 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  44.15 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  47.19 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  44.29 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  46.04 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.49 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  40.28 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  43.97 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  38.71 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  36.13 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  35.34 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  33.97 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  38.85 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  52.46 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  30.21 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.92 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  34.22 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  27.36 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  27.67 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  31.63 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.49 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  30.81 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  22.53 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.43 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  22.59 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  26.52 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  26.52 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  26.72 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  27.1 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  26.11 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  24.27 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.4 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  23.95 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  26.72 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  28.09 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  26.21 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  28.1 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  30.68 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  26.34 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  29.63 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  30.22 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  30.22 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  23.79 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  24.91 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  26.34 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  29.76 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.55 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  22.22 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  28.15 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.72 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.26 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  28.19 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  24.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  28.44 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  23.85 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.49 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.53 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  24.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  24.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  31.68 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.34 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  24.33 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  28.43 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>