More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1542 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 292 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  67.01 
 
 		 289 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  57.59 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  52.92 
 
 		 305 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.77 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.81 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  39.8 
 
 		 315 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  38.06 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  41.89 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  39.59 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  41.55 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  36.86 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  31.12 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  30.34 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.34 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.23 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  30.14 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.45 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  32.55 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.45 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.09 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.09 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.24 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.09 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.09 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.09 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.09 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.09 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.33 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.08 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  32.2 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.27 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  28.77 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.91 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  32.54 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  27.42 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.72 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  31.53 
 
 		 309 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.69 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  28.97 
 
 		 313 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.37 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.74 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.69 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.37 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.34 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  26.09 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.82 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  27.92 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.92 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.56 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.85 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.73 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.16 
 
 		 324 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  26.55 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  27.72 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.14 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.08 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  27.43 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  26.01 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.61 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  26.37 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.59 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  31.02 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>