123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3877 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.84 
 
 		 295 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  82.43 
 
 		 296 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  78.91 
 
 		 294 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  64.58 
 
 		 296 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.22 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  60.14 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  56.25 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  56.4 
 
 		 290 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  57.19 
 
 		 290 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  53.36 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  55.71 
 
 		 284 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  54.48 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  54.77 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  56.23 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.32 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  48.46 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  55.99 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  48.56 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  51.62 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  41.33 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  42.76 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  42.76 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  40.49 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  39.3 
 
 		 280 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  40.14 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  37.09 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  30.93 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  29.14 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  29.69 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  28.47 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  28.23 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  29.1 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  28.23 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  28.23 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  28.29 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  28.68 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  28.29 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  39.49 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  24.78 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  28.5 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  28.5 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  28.5 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  30.11 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  28.29 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  26.54 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  26.54 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  27.33 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  25.85 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  24.51 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  30.46 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  24.18 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  24.18 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  23.43 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  24.92 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  25.59 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  23.03 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.38 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  24.43 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.72 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.15 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  27 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.44 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.27 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  25.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  23.53 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  23.85 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  26.45 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  30.87 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  26.22 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.48 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.9 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  26.17 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  25.7 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  32.69 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  24.43 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  27.13 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>