74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3410 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  88.93 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  79.28 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  79.26 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  71.1 
 
 		 308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.76 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  71.43 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  70.71 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  70.43 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  69.31 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  71.23 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  69.44 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  68.98 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  69.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  52.07 
 
 		 302 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  52.07 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  49.67 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  50.52 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  48.28 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  48.3 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.95 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.25 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.71 
 
 		 365 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  46.15 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.64 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.05 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  24.76 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  28.2 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  26.97 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  25.45 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  24.83 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  23.66 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24.21 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  26.3 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.19 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  29.69 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  24.21 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  23.32 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  23.32 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  27.06 
 
 		 280 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.27 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  21.85 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  20.59 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  20.59 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  28.25 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.27 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  20.68 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.57 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  20.34 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.06 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  27.13 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  25.27 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>