103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0303 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.91 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  47.04 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  46.85 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  49.65 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  48.07 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  45.91 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.71 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  44.84 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  45.79 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  50.17 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.7 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  45.62 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  44.48 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.1 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  45.1 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  44.48 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  47.37 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  44.14 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  44.76 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  44.76 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  43.45 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  44.76 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  47.08 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  46.35 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.57 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.26 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.57 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.12 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.3 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  36.09 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.91 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  29.39 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  28.99 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  28.8 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  28.27 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  27.57 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.35 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.36 
 
 		 307 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  29.25 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  28.73 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.82 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  24.83 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.41 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.32 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.08 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  28.72 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.89 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.79 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  40.51 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.79 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.53 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.53 
 
 		 312 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  40.51 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.3 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.33 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29.7 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  29.52 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  24.3 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.13 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.94 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  26.79 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  26.79 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  39.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  26.42 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.9 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.86 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  25.64 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.3 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  28.14 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  21.95 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.83 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.05 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>