More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4286 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  76.41 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  65.98 
 
 		 294 aa  358  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  65.98 
 
 		 294 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  61.72 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  46.82 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  50.53 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  242  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  51.27 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  46.21 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  45.7 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  48.36 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.36 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.1 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.37 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  53.15 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  48.83 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.33 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.35 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.28 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  43.11 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  46.57 
 
 		 346 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  50.19 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.28 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  49.66 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  41.02 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.53 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  37.02 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.01 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  36.64 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  36.26 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  35.5 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  37.11 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  37.11 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  36.72 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  36.33 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.02 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  31.88 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.97 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.56 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  32.66 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  29.21 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.2 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.07 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  30.96 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  30.96 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.74 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.57 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  29.83 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  29.25 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.4 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  28.87 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  30.71 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  22.92 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.26 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  29.28 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  32.59 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  25.53 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  28.18 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  26.39 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  27.86 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.18 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  28.7 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.27 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>